Posttranslationale Modifikation

Posttranslationale Proteinmodifikationen (PTM) sind Veränderungen von Proteinen, die nach der Translation stattfinden. Die meisten werden durch den Organismus oder durch die Zellen selbst ausgelöst.

An diesen Prozessen beteiligt sind häufig Proteine, die durch Modifizierungsgene (modifier genes) codiert werden. Die Genprodukte solcher Modifizierungsgene können abhängig von Umweltfaktoren gebildet oder funktionalisiert werden und Proteine entsprechend beeinflussen.

Während einige der Prozesse unmittelbar am Entstehungsort ablaufen, finden andere an bestimmten Zellorganellen statt, wieder andere erst außerhalb der produzierenden Zelle.

Neben beabsichtigten Proteinveränderungen treten aber auch ungewollte Proteinmodifikationen auf. Geht man davon aus, dass die Transkriptions- und Translationsmaschinerie bei der Umschrift der Gene über die mRNA zu den Proteinen mit Fehlerquoten von 1/1000 Nukleotiden oder 1/10.000 Aminosäuren arbeiten, so werden durch den Einbau falscher Aminosäuren nicht unerhebliche Mengen misstranslatierter Polypeptidketten produziert. Der Anteil misstranslatierter Proteine, die eigentlich nicht wirklich posttranslational, sondern cotranslational verändert werden, kann durch Anwesenheit von Streptomycin (Störung des Ribosoms) bzw. durch Mangel einzelner Aminosäuren erhöht werden.

Zusätzlich können Proteinketten durch Radikale, durch hochenergetische Strahlung oder andere Proteine (siehe Prionen) beschädigt, verändert oder denaturiert werden und Faltungsisoformen bilden, die der Ursprungskonformation nicht mehr entsprechen und die vorgesehene Funktion nicht erfüllen können.

Kategorien posttranslationaler Modifikation

Zellen besitzen eine Vielzahl von Möglichkeiten, ihre Proteine zu bearbeiten und zu verändern. Dazu besitzen sie eine Vielzahl von Enzymen, die eigens für die Proteinmodifikation von der Zelle gebildet werden. Proteinmodifikationsprozesse können konstitutiv ablaufen oder aber durch Umwelteinflüsse oder andere Parameter beeinflusst werden. Folgende Vorgänge, die zu neuen Proteinspezies führen, wurden analysiert:

Abspaltungen

Abspaltung des N-terminalen Formylrestes durch die Deformylase. Jedes neu synthetisierte Protein (in Prokaryoten) enthält anfangs ein N-terminales Formylmethionin (Methionin bei Eukaryoten), welches bei der Translation immer zuerst eingebaut wird und dessen Formylrest im Folgenden durch die Deformylase abgespalten wird. Ein noch vorhandener Formylrest zeigt die gerade erst beendete Synthese des Proteinmoleküls an;
die Abspaltung des Methionylrests am N-Terminus neusynthetisierter Proteine durch die Methionylaminopeptidase. Bei Bakterien konnte man beobachten, dass die Größe der folgenden Aminosäure das Abspaltungsverhalten des N-terminalen Methionins beeinflusst. Je größer die zweite Aminosäure ist, desto unwahrscheinlicher wird eine Abspaltung des Startmethionins;
die gezielte Abspaltung von Signalsequenzen (etwa Protokollagen zu Kollagen);
das selektive Herausschneiden von Teilsequenzen (etwa Proinsulin zu Insulin, generell Präkursor-Proteine);
Proteininaktivierung und –fragmentierung durch Proteolyse, an der Proteasen beteiligt sind;

Anorganische Gruppen

Phosphorylierungen durch Proteinkinasen zu Phosphoproteinen;
Hydroxylierung von Prolin-Resten zu Hydroxyprolin-Resten (nur im Kollagen)
Hydroxylierung von Lysin-Resten zu Hydroxylysin-Resten (häufig Ausgangspunkt für Glykosylierungen, im Kollagen auch für anschließende Quervernetzungen)
Iodierung und Bromierung, z. B. L-Thyroxin, v. a. in Weichtieren, Neuropeptid-B des Rinds
Nitrierung
S-Nitrosylierung
Sulfatierung

Organische Gruppen

Glykosylierungen (Glykoproteine); N-glykosidisch im endoplasmatischen Retikulum, O-glykosidisch im Golgi-Apparat
Formylierung bei Prokaryoten im Formylmethionin
Acetylierung durch Acetylasen an Lysinen, z. B. Histon-Deacetylase und Histon-Acetyltransferase
Methylierung, z. B. asymmetrisches Dimethylarginin, Histon-Methyltransferasen an Lysinen
Biotinylierung
Amidierung, z. B. am C-Terminus
Ubiquitinylierung an Lysinen zur Proteolyse
SUMO-Protein (engl. Small Ubiquitin-related Modifier) zur Proteolyse
ADP-Ribosylierung, z. B. durch die Poly(ADP-ribose)-Polymerase 1
Succinylierung an Lysinen mit Succinat
Anhängen eines Citrullin-Rests (CXCL10, Filaggrin, mehrere Histone)
Addition von Glutathion über eine Disulfidbrücke (beta-Crystallin, Glutaredoxin-2)
Bindung an Chinone, hauptsächlich beim Elektronentransport
Liponsäure-Modifikation, z. B. an der Pyruvat-Dehydrogenase durch die Lipoat-Proteinligase
Flavinmodifikationen, z. B. Flavinmononukleotid oder Flavin-Adenin-Dinukleotid
Häm-modifikationen, z. B. Häm C an Lysinen
Retinylidenmodifikation als Schiffsche Base aus Retinal bei Opsinen

Organische Lipidgruppen

Diese Lipid-Modifikationen bewirken eine Adsorption an die Zellmembran.

GPI-Anker
Lipidmodifikationen durch Prenylierung zu Lipoproteinen, z. B. Farnesyl, Geranylgeranyl
Lipidmodifikationen durch langkettige Acylierung mit Fettsäuren zu Lipoproteinen, z. B. Palmitat und Myristat

Hinzufügen von Bindungen

das Knüpfen von Disulfidbrücken zwischen benachbarten Cystein-Resten zum Cystin (etwa Insulin);
die Veränderung der Faltung durch Chaperone;
die Bildung von Proteinkomplexen aus Untereinheiten (etwa Hämoglobin);
die Bildung von festen Strukturen über kovalente Quervernetzungen (etwa Kollagen-Fibrillen);
Knüpfung einer Isopeptidbindung, bspw bei der Blutgerinnung
Bildung einer Thioester-Bindung zwischen Cys und Asn/Gln (u.a. Komplementkomponente C3)
Bildung einer Thioether-Bindung zwischen Cys und Ser/Thr (Amatoxine und weitere)

Bindung an größere Moleküle

die Verknüpfung mit Coenzymen und prosthetischen Gruppen (etwa Häm + Hämoglobin);
Kovalente Bindung an DNA und RNA (nur Viren)
kovalente Verankerung an Peptidoglycane in Zellwänden von Bakterien

Veränderung einzelner Aminosäuren

L-/D-Isomerisierung: die Veränderung einer L-Aminosäure zur D-Aminosäure, bisher nachgewiesen in mehreren Tiergruppen (ausschließlich Gifte der Amphibien, Arthropoden, Mollusken und des Schnabeltiers)
Vitamin K-abhängige Carboxylierung eines Glutamat-Rests zu 1-Carboxyglutamat (Koagulation und calcifizierte Gewebe)
Umwandlung eines Lysin zu Hypusin (N-ε-(4-aminobutyl)lysin). Einziges bekanntes Protein: eIF-5A
Oxidation von einzelnen Aminosäureresten (Crystalline)
Ringschluss von Glutaminsäure zur Pyroglutaminsäure

Diverses

Bildung eines stabilen Radikals (Bakterien)
die Bindung (Komplexierung) von Ionen und niedermolekularen Substanzen;

Weblinks

UniProt Keyword: PTM
UniProt: Controlled vocabulary of posttranslational modifications (PTM)