SYBR Green I
| Strukturformel | ||||||||
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| Allgemeines | ||||||||
| Name | SYBR Green I | |||||||
| Andere Namen |
2-{2-[(3-Dimethylamino-propyl)- propylamino]-1-phenyl- 1H-chinolin-4-ylidenmethyl}- 3-methyl-benzothiazol-3-ium-Kation | |||||||
| Summenformel | C32H37N4S+ | |||||||
| CAS-Nummer | 163795-75-3 | |||||||
| Eigenschaften | ||||||||
| Molare Masse | 509,27 g·mol−1 | |||||||
| Aggregatzustand |
fest | |||||||
| Löslichkeit | ||||||||
| Sicherheitshinweise | ||||||||
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| Soweit möglich und gebräuchlich, werden SI-Einheiten verwendet. Wenn nicht anders vermerkt, gelten die angegebenen Daten bei Standardbedingungen. | ||||||||
SYBR Green I (SG) ist ein asymmetrischer Cyanin-Farbstoff, der in der Molekularbiologie zum Nachweis von doppelsträngiger DNA benutzt wird.[2][3][4]
Eigenschaften
SYBR Green I bindet doppelsträngige DNA. Der daraus resultierende DNA-Fluoreszenzfarbstoff-Komplex absorbiert blaues Licht bei einer Wellenlänge λmax = 494 nm und emittiert grünes Licht bei λmax = 521 nm. Weitere, wenn auch deutlich schwächere, Absorptionsmaxima liegen im UV-Bereich bei 284 nm und 382 nm.
SYBR Green I bindet auch an Einzelstrang-DNA sowie RNA. Dieses Fluoreszenzsignal ist aber deutlich geringer, als wenn der Farbstoff an einer doppelsträngigen DNA gebunden ist.
Verwendung
SYBR Green I ersetzt bei vielen Anwendungen Ethidiumbromid. Es wird zur Detektion von doppelsträngiger DNA verwendet.
Anwendungsfelder sind:
- Gelelektrophorese und
- Real time quantitative PCR
- Vitalitätstests bei Zellkulturen
Ähnliche Cyanin-Farbstoffe sind:
- SYBR Green II (zum Nachweis von RNA und einzelsträngiger DNA),
- SYBR Gold,
- SYBR Safe,
- YO (Oxazole Yellow),
- TO (Thiazole Orange) und
- PG (PicoGreen).
Einzelnachweise
- ↑ Datenblatt SYBR Green I bei Sigma-Aldrich, abgerufen am 15. Juni 2011.
- ↑ Richard P. Haugland et al. (1995): Cyclic-substituted unsymmetrical cyanine dyes. Patent US-5436134.
- ↑ Stephen T. Yue et al. (1997): Substituted unsymmetrical cyanine dyes with selected permeability. Patent US-5658751. Dye No. 211.
- ↑ Zipper, H. et al. (2004): Investigations on DNA intercalation and surface binding by SYBR Green I, its structure determination and methodological implications. In: Nucleic Acids Res. 32(12): e103; PMID 15249599; PMC 484200.