NotI
notI (Nocardia otitidiscaviarum) | ||
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Vorhandene Strukturdaten: 3BVQ, 3C25 | ||
Masse/Länge Primärstruktur | 383 Aminosäuren | |
Sekundär- bis Quartärstruktur | Homodimer | |
Bezeichner | ||
Gen-Name(n) | notI (Rebase) | |
Externe IDs | UniProt: Q2I6W2 | |
Enzymklassifikation | ||
EC, Kategorie | 3.1.21.4 Restriktionsenzym | |
Reaktionsart | Hydrolyse | |
Substrat | DNA | |
Produkte | Zweisträngige DNA-Fragmente mit terminalen 5'-Phosphatgruppen |
Das Enzym Not I ist ein Restriktionsenzym vom Typ II, eine Endonuklease, die DNA an einer spezifischen Stelle schneidet. Das Enzym wurde aus dem Bakterium Nocardia otitidis-cavarium isoliert. Es besitzt eine sequenzspezifische Erkennungsstelle auf der DNA, an der es spezifisch binden und die DNA an dieser Stelle schneiden kann. Das zugehörige Gen wurde sequenziert und kloniert.
Erkennungssequenz | Restriktionsschnitt |
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5'-GCGGCCGC-3' 3'-CGCCGGCG-5' |
5'-GC GGCCGC-3' 3'-CGCCGG CG-5' |
Bei der Durchtrennung der DNA entstehen einzelsträngige Überhänge, die aufgrund ihrer Affinität zu komplementären Sequenzen als sticky ends bezeichnet werden. Im Experiment kann das Enzym durch Hitze-Denaturierung, beispielsweise bei 65 °C für 20 Minuten, inaktiviert werden.
Literatur
- Giedre Tamulaitiene & Virginijus Siksnys (2008): NotI is not boring. In: Structure. Bd. 16, Nr. 4, S. 497-498. PMID 18400171